나뭇잎 교과서

DNA 복제

세포가 분열할 때마다 30억 쌍의 염기가 거의 틀림없이 복사됩니다. 이중 나선의 두 가닥은 복제 후 어떻게 나뉘어 새 DNA에 들어갈까요?

본문

DNA 복제

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세포가 분열하기 전에 DNA는 똑같이 하나 더 만들어진다. 이중 나선 구조가 밝혀지자 복제 방식에 세 가지 가능성이 떠올랐다. 원래 DNA는 그대로 두고 완전히 새 DNA를 만드는 방식, 두 가닥을 풀어 각각을 주형으로 새 가닥을 붙이는 방식, 조각조각 섞이는 방식이다. 1958년 메셀슨과 스탈은 질소 동위 원소로 이 셋을 가려냈다. 어떻게 했을까?

그림 1. ¹⁵N 배지에서 기른 대장균을 ¹⁴N 배지로 옮겨 기르며 DNA를 원심 분리한 결과. 1세대에는 중간 무게의 띠 하나만, 2세대부터는 중간과 가벼운 띠가 나타난다.
먼저 알아야 할 것DNA 이중 나선과 염기 상보성(DNA 구조와 유전 물질의 규명), 세포 분열, 밀도에 따른 원심 분리.

1.7.1메셀슨–스탈 실험

질소의 무거운 동위 원소 ¹⁵N이 든 배지에서 대장균을 여러 세대 기르면 DNA의 염기가 모두 ¹⁵N을 가져 무거워진다. 이 대장균을 보통 질소 ¹⁴N 배지로 옮기면 그 뒤에 만들어지는 가닥은 가볍다. DNA를 염화 세슘 용액에서 원심 분리하면 밀도에 따라 서로 다른 높이에 띠가 생기므로, 무거운 DNA, 가벼운 DNA, 반반인 DNA를 구별할 수 있다.

정리 1.7.1 반보존적 복제

DNA는 두 가닥이 풀린 뒤 각 가닥이 주형이 되어 상보적인 새 가닥을 만든다. 그래서 새 DNA는 모두 원래 가닥 하나와 새 가닥 하나로 되어 있다.

그림 1에서 세대를 바꾸어 보자. 1세대 DNA는 모두 중간 무게였다. 원래 DNA를 그대로 두는 보존적 복제라면 무거운 띠와 가벼운 띠가 나와야 하므로 이 가능성은 버려졌다. 2세대에는 중간과 가벼운 띠가 반반이었다. 조각조각 섞이는 방식이라면 띠가 하나로 점점 가벼워져야 하므로 이것도 버려졌다. 그래서 반보존적 복제만 남았다.1

1.7.2복제의 과정

헬리케이스가 이중 나선을 풀면 DNA 중합 효소가 각 가닥을 주형으로 새 뉴클레오타이드를 붙인다. 중합 효소는 새 가닥을 한쪽 방향(5′→3′)으로만 늘릴 수 있다. 두 가닥은 방향이 반대이므로, 한 가닥(선도 가닥)은 풀리는 방향으로 계속 이어지고, 다른 가닥(지연 가닥)은 짧은 조각으로 거꾸로 만들어진 뒤 연결 효소가 조각을 잇는다. 이 짧은 조각을 발견자의 이름을 따서 오카자키 절편이라 한다.

모형1세대2세대 보존적무거움 + 가벼움무거움 1 : 가벼움 3 반보존적중간만중간 1 : 가벼움 1 분산적중간만중간보다 가벼운 띠 하나
그림 2. 1세대와 2세대의 결과를 함께 보면 세 모형 가운데 반보존적 복제만 맞는다.

1.7.3예제 풀이

예제 1.7.2

메셀슨–스탈 실험에서 ¹⁴N 배지로 옮긴 뒤 3세대의 DNA 가운데 중간 띠와 가벼운 띠의 비는 얼마인가? 또 대장균 유전체 460만 염기쌍을 복제 분기점 두 개가 반대 방향으로 1초에 1000 염기씩 복제하면 복제에 몇 분이 걸리는가?

3세대에는 DNA가 \(2^3 = 8\)개이고, 원래 ¹⁵N 가닥 2개가 각각 다른 DNA에 들어 있다. 그래서 중간이 2개, 가벼운 것이 6개로 비는 1 : 3이다. 세대가 늘어도 중간 띠의 DNA 수는 2개로 그대로이고, 비율만 \(\dfrac{2}{2^n}\)로 줄어든다.

두 분기점이 함께 1초에 2000 염기쌍씩 복제하므로 \(\dfrac{4.6 \times 10^6}{2000} = 2300\) s, 곧 약 38분이다. 그런데 대장균은 좋은 조건에서 20분마다 분열한다. 이는 이전 복제가 끝나기 전에 다음 복제를 시작해 겹쳐 진행하기 때문이다. 사람은 유전체가 훨씬 길어 염색체마다 수천 곳에서 동시에 복제를 시작한다.

아래 탐구 카드에서 DNA가 복제될 때 원래 가닥이 어디로 가는지 세대별로 직접 따라가 보자.

  1. 이 실험은 '생물학에서 가장 아름다운 실험'으로 불린다. 결과가 너무 뚜렷하여 세 가설 가운데 둘을 한 번에 지웠기 때문이다.
마무리

DNA는 두 가닥이 풀려 각각 주형이 되는 반보존적 방식으로 복제되며, 메셀슨과 스탈은 ¹⁵N과 ¹⁴N으로 표지한 DNA의 띠로 이를 확인했다. 중합 효소는 한 방향으로만 가닥을 늘려, 선도 가닥은 이어서, 지연 가닥은 조각으로 만든다. 그래서 처음 질문의 원래 가닥은 두 새 DNA에 하나씩 나뉘어 들어가 새 가닥과 짝을 이룬다.

탐구 1

DNA가 복제될 때 원래 가닥은 어디로 갈까?

메셀슨–스탈 실험 · 반보존적 복제
예측되는 띠 (무거운 ¹⁵N/¹⁵N : 중간 : 가벼운 ¹⁴N/¹⁴N)
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1958년 실제 관찰
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이 모형은
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대장균을 무거운 질소(¹⁵N) 배지에서 여러 세대 키운 뒤 보통 질소(¹⁴N) 배지로 옮기고, 세대마다 DNA를 염화 세슘 밀도 기울기 원심 분리로 분석한 실험이다.

  1. 질문왓슨과 크릭은 이중 나선 구조를 발표하며 염기쌍의 규칙이 곧 복제 방법을 암시한다고 썼다. 두 가닥이 풀려 각각 새 가닥의 틀이 된다면, 복제된 DNA의 두 가닥 중 원래 가닥은 몇 개일까? 이것을 어떻게 확인할 수 있을까?
  2. 복원DNA의 두 가닥은 A–T, G–C의 상보적 염기쌍으로 이어져 있어, 한 가닥의 서열을 알면 다른 가닥을 알 수 있다(DNA의 구조).
  3. 설명메셀슨과 스탈은 질소 동위 원소로 DNA의 무게를 다르게 만들어 원래 가닥(¹⁵N, 무거움)과 새 가닥(¹⁴N, 가벼움)을 구별했다. ¹⁴N 배지로 옮긴 뒤 1세대 DNA는 모두 중간 무게 띠 하나였고, 2세대는 중간과 가벼운 띠가 1 : 1이었는데, 이는 복제된 DNA가 원래 가닥 하나와 새 가닥 하나로 이루어진다는 반보존적 복제와 들어맞는다. 1세대에서 띠가 하나라는 결과로 보존적 복제가, 2세대에 가벼운 띠가 따로 나타난다는 결과로 분산적 복제가 제외되었다.
  4. 연결세포 안에서는 헬리케이스가 이중 나선을 풀고, DNA 중합 효소가 각 가닥을 틀로 새 가닥을 5′→3′ 방향으로만 이어 붙인다. 그래서 복제 분기점이 움직이는 방향으로 이어서 합성되는 선도 가닥과, 짧은 조각(오카자키 절편)으로 끊어 합성한 뒤 연결 효소로 잇는 지연 가닥이 생긴다. 그리고 반보존적 복제 덕분에 세포 분열 때 두 딸세포는 같은 유전 정보를 받는다.
  5. 적용세 모형을 바꿔 가며 0~4세대의 띠를 예측하고 실제 관찰과 비교해 보자. 그리고 반보존적 복제에서 n세대의 중간 띠와 가벼운 띠의 비율을 일반화하고, 3세대 결과만 보고도 모형을 구별할 수 있는지 확인해 보자.
  6. 판단이 실험이 가장 아름다운 생물학 실험으로 불리는 것은, 가능한 세 가설이 서로 다른 결과를 예측하도록 실험을 설계했기 때문이다. 좋은 실험은 결과가 어느 쪽으로 나오든 가설을 가려낼 수 있어야 한다. 또 1세대 결과만으로는 반보존과 분산을 구별할 수 없다는 것도 눈여겨보자.

확인조건이 달라지면

반보존적 복제에서 ¹⁴N 배지로 옮긴 뒤 3세대 DNA의 띠 비율(중간 : 가벼운)은?

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