나뭇잎 교과서

대립유전자 빈도 모의실험

붉은 콩과 흰 콩을 담은 주머니 하나면 교실에서 몇십 세대의 진화를 재현할 수 있습니다. 뽑기 규칙을 어떻게 정해야 자연선택이나 이주가 되고, 주머니 크기는 결과를 어떻게 바꿀까요?

먼저 알면 좋은 것 유전자풀과 대립유전자 빈도하디·바인베르크 평형카이제곱 검정
본문

대립유전자 빈도 모의실험

본문

주머니에 빨간 구슬 60개(대립유전자 A)와 흰 구슬 40개(a)를 넣고, 두 개씩 꺼내 한 개체의 유전자형으로 삼는 모의실험을 했다. 흰 구슬 두 개인 aa 개체는 살아남지 못한다고 정하고, 세대마다 aa를 빼고 남은 구슬로 다음 세대를 만들었다. 첫 세대에 40%이던 흰 구슬은 둘째 세대에 29%, 셋째 세대에 22%, 넷째 세대에 18%로 줄었다. 그런데 줄어드는 빠르기가 점점 느려진다. 흰 구슬은 결국 사라질까? 왜 점점 느려질까?

세대12341020 a의 빈도 q0.400.290.220.180.090.05 aa의 빈도 q²0.160.080.050.030.0080.002 q는 매 세대 q/(1 + q)로 바뀌어, 줄어드는 빠르기가 점점 느려진다
그림 1. 열성 개체를 모두 없애도 a의 빈도는 빠르게 0이 되지 않는다. 대부분의 a가 형질이 드러나지 않는 Aa 속에 숨어 있기 때문이다.
먼저 알아야 할 것대립유전자와 유전자형, 확률의 곱셈, 가계 조사(가계 조사와 사람의 유전).

3.10.1아무 일도 없으면 빈도는 그대로

집단 속 대립유전자 A의 빈도를 \(p\), a의 빈도를 \(q\)라 하자(\(p + q = 1\)). 개체들이 무작위로 짝짓고, 선택, 돌연변이, 이주가 없으며, 집단이 충분히 크면 다음 세대에도 \(p\)와 \(q\)는 바뀌지 않는다. 이때 유전자형의 빈도는 구슬 두 개를 무작위로 꺼낼 때의 확률과 같아 AA가 \(p^2\), Aa가 \(2pq\), aa가 \(q^2\)이다. 이것을 하디-바인베르크 평형이라 한다. 진화는 이 조건이 깨져 대립유전자 빈도가 바뀌는 것이다.

정리 3.10.1 열성 개체를 없애는 선택

세대마다 aa 개체를 모두 없애면 다음 세대의 a의 빈도는 \[q' = \frac{q}{1 + q}\]이다. \(q\)가 작아지면 a의 대부분이 Aa 속에 있게 되어, 선택이 a를 거의 없애지 못한다.

a의 빈도가 0.4일 때 aa는 16%로 꽤 많아 한 세대에 많은 a를 없앤다. 그러나 a의 빈도가 0.04로 줄면 aa는 0.16%뿐이고, a의 대부분인 96%가 형질이 드러나지 않는 Aa 속에 숨어 있다. 선택은 형질이 드러난 aa에만 작용하므로, 숨은 a는 그대로 다음 세대로 넘어간다. 그래서 열성 대립유전자는 아무리 강하게 선택해도 아주 느리게 줄어들 뿐 쉽게 사라지지 않는다.1

3.10.2작은 집단의 우연

구슬을 몇 개만 꺼내는 작은 집단에서는 선택이 없어도 우연히 한쪽 구슬이 더 많이 뽑혀 빈도가 세대마다 흔들린다. 이것을 유전적 부동이라 한다. 큰 집단에서는 흔들림이 서로 상쇄되어 작지만, 개체가 10마리뿐인 집단에서는 몇 세대 만에 한 대립유전자가 사라지기도 한다. 모의실험에서 매 세대 꺼내는 구슬 수를 바꾸어 보면, 작은 집단일수록 빈도가 크게 요동치는 것을 확인할 수 있다.

유전자형AAAaaa 식p²2pqq² p = 0.6, q = 0.40.360.480.16 p = 0.96, q = 0.040.92160.07680.0016
그림 2. a가 드물어지면 a를 가진 개체는 거의 모두 Aa이고, aa는 아주 드물다.

3.10.3예제 풀이

예제 3.10.2

처음 \(q = 0.4\)에서 aa를 세대마다 없앨 때 둘째 세대의 \(q\)를 구하여 그림 1을 확인하여라. \(q = 0.04\)일 때 a 가운데 Aa 속에 숨어 있는 비율은 얼마인가? q가 0.4에서 0.04로 줄어드는 데는 몇 세대가 걸리는가? 이 선택에서는 \(1/q\)가 세대마다 1씩 늘어난다.

\(q' = 0.4/1.4 \approx 0.286\)으로 그림 1의 0.29와 같다. \(q = 0.04\)일 때 a의 전체는 Aa의 \(2pq = 0.0768\)의 절반과 aa의 \(q^2 = 0.0016\)에서 온다. 대립유전자 수로 보면 Aa 속의 a는 \(0.0768\), aa 속의 a는 \(2 \times 0.0016 = 0.0032\)이므로, Aa 속에 숨은 비율은 \(0.0768/0.08 = 96\)%이다.

\(q' = q/(1+q)\)에서 \(1/q' = 1/q + 1\)이므로, \(1/q\)는 2.5에서 시작해 세대마다 1씩 늘어난다. \(q = 0.04\)는 \(1/q = 25\)이므로 \(25 - 2.5 = 22.5\), 곧 약 22세대가 걸린다. 다시 0.004로 줄이려면 \(250 - 25 = 225\)세대가 더 걸린다. 즉 열성 대립유전자는 형질이 드러나지 않는 보인자 속에 숨어 있어, 선택만으로는 아주 느리게 줄어든다.

아래 탐구 카드에서 구슬 모의실험으로 선택과 유전적 부동이 대립유전자 빈도를 어떻게 바꾸는지 확인해 보자.

  1. 이 평형은 1908년 영국의 수학자 하디와 독일의 의사 바인베르크가 따로 발표했다. 하디는 열성 형질이 우성 형질에 밀려 결국 사라질 것이라는 생물학자들의 생각이 틀렸다는 것을 간단한 계산으로 보였다.
마무리

무작위 교배하는 큰 집단에서 선택, 돌연변이, 이주가 없으면 대립유전자 빈도가 유지되고 유전자형은 \(p^2\), \(2pq\), \(q^2\)의 비율을 이룬다. 열성 개체를 없애는 선택은 \(q' = q/(1+q)\)로 a를 줄이지만, a가 드물어질수록 대부분이 보인자 속에 숨어 줄어드는 빠르기가 느려지고, 작은 집단에서는 우연에 따른 유전적 부동도 빈도를 바꾼다. 처음 질문의 흰 구슬은 결국 줄어들지만 쉽게 사라지지 않는다.

탐구 1

작은 섬의 생물 집단에서는 왜 우연이 진화를 이끌까?

유전자풀 · 대립유전자 빈도 · 진화의 요인 (시뮬레이션)
세대
0
A 고정 (p=1)
0
A 소실 (p=0)
0
평균 이형 접합 비율
—

교육용 모식 시뮬레이션(라이트-피셔 모형)이다. 가는 선 8개는 같은 조건에서 출발한 서로 다른 집단이고, 굵은 점선은 집단이 무한히 클 때(우연이 없을 때) 예상되는 빈도이다. 선택은 AA, Aa, aa의 상대 적합도를 1+s : 1+s/2 : 1로 두었고, 돌연변이는 A→a, a→A가 같은 비율로 일어난다고 가정했다.

  1. 질문큰 대륙에서는 수백 년이 지나도 비슷하던 형질이, 작은 섬에 고립된 몇십 마리 집단에서는 몇십 세대 만에 한쪽으로 쏠리거나 아예 사라지곤 한다. 더 유리한 형질도 아닌데 왜 그럴까?
  2. 복원한 집단이 가진 유전자 전체를 유전자풀이라 하고, 유전자풀에서 어떤 대립유전자가 차지하는 비율이 대립유전자 빈도이다. 예를 들어 50마리(대립유전자 100개) 가운데 A가 60개이면 p(A) = 0.6, q(a) = 0.4이고, p + q = 1이다. 그리고 진화는 세대가 지나며 유전자풀의 대립유전자 빈도가 바뀌는 것이다.
  3. 설명집단이 매우 크고, 돌연변이, 이주, 자연선택이 없고, 무작위로 짝짓기하면 대립유전자 빈도는 세대가 지나도 변하지 않는다(하디-바인베르크 평형). 이때 유전자형 빈도는 AA : Aa : aa = p² : 2pq : q²이다. 그래서 이 조건이 깨지면 진화가 일어나고, 빈도를 바꾸는 요인은 돌연변이, 자연선택, 유전자 흐름(이주), 유전적 부동(우연) 네 가지이다.
  4. 연결유전적 부동은 다음 세대에 전해질 대립유전자를 부모 세대에서 무작위로 뽑을 때 생기는 표본 오차이다. 동전을 10번 던지면 앞면이 7번 나오기 쉽지만 1000번 던지면 70%가 나오기 어려운 것처럼, 집단이 작을수록 빈도가 크게 흔들린다. 집단 크기가 갑자기 줄었다 회복되는 병목 효과, 소수가 새 지역에 정착하는 창시자 효과는 부동이 특히 크게 작용하는 경우이다.
  5. 적용'유전적 부동'에서 N을 20에서 1000으로 바꿔 가며 다시 실행하고, 고정되거나 소실되는 집단 수를 비교해 보자. '자연선택'에서 N을 20으로 줄이면 유리한 A도 사라지는 집단이 나오는지, '유전자 흐름'에서 이주율 m을 0으로 하면 집단끼리 어떻게 달라지는지도 확인해 보자.
  6. 판단유전적 부동은 유리한 형질을 고르지 않는다. 그래서 '진화는 늘 적응 방향으로 일어난다'는 생각은 틀렸다. 또 유전자 흐름은 집단 사이의 차이를 줄이고, 부동은 차이를 키운다. 이 모형은 세대가 겹치지 않고 무작위로 짝짓기하는 단순한 집단을 가정하므로, 실제 생물에서는 성비, 짝 선택, 세대 겹침 때문에 결과가 달라질 수 있다.

확인조건이 달라지면

같은 대륙 집단(p = 0.5)에서 각각 4마리가 서로 다른 작은 섬 10곳에 정착했다. 이주와 선택이 없을 때 100세대 뒤의 모습으로 가장 알맞은 것은?

탐구 2

콩 주머니에서 짝을 뽑아 세대를 넘기면 대립유전자 빈도는 어떻게 변할까?

실험 · 모의실험 설계 · 유전자풀 · 하디·바인베르크 평형
규칙

주머니에는 콩 200개가 들어 있습니다. 두 개씩 꺼내 한 개체의 유전자형으로 기록하세요.

세대 · 주머니의 p
—
이번 세대 AA : Aa : aa
—
하디·바인베르크 기댓값 · χ²
—

붉은 콩 = 대립유전자 A, 흰 콩 = a. 다음 세대 주머니는 살아남은 개체의 콩 비율에 맞춰 콩 200개로 다시 채운다(살아남은 개체가 무작위로 짝짓기해 생식세포를 많이 만드는 것에 해당). 이주는 매 세대 뽑은 개체 수의 10%만큼 aa 개체(흰 콩만 있는 다른 집단)가 들어오는 규칙이다. 그래프의 점선은 무한히 큰 집단에서 기대되는 p, 회색 선은 앞 모둠들의 결과이다.

  1. 탐구 문제교실에서 콩과 주머니만으로 몇 세대에 걸친 진화를 재현할 수 있을까? 아무 선택이 없을 때와 특정 유전자형이 덜 살아남을 때, 대립유전자 빈도는 세대마다 어떻게 달라질까?
  2. 복원한 집단의 대립유전자 전체가 유전자풀이다. 집단이 크고, 돌연변이·이주·선택이 없고, 무작위로 짝짓기하면 대립유전자 빈도 p, q는 세대가 지나도 변하지 않고, 유전자형 비율은 p² : 2pq : q²이 된다(하디·바인베르크 평형). 이 조건이 깨지면 빈도가 변하는데, 이것이 집단 수준의 진화이다.
  3. 설계주머니 = 유전자풀, 콩 한 개 = 대립유전자, 콩 두 개 = 한 개체이다. 조작 변인은 규칙(선택, 이주의 유무)과 뽑는 개체 수 N, 종속 변인은 세대별 p이다. 콩의 크기·촉감이 같아야 무작위로 뽑히니, 눈을 감고 섞은 뒤 꺼낸다. 같은 조건으로 여러 모둠이 실험해 결과를 겹쳐 본다.
  4. 분석p = (2 × AA + Aa) / (2 × 개체 수)로 구한다. ‘무작위로만’에서는 p가 위아래로 흔들리며 모둠마다 다른 방향으로 간다(유전적 부동). aa를 제거하면 p가 꾸준히 커지지만, q가 작아질수록 aa가 드물어져 변화가 느려진다. a는 Aa 속에 숨어 쉽게 사라지지 않는다. 이론값 q′ = q(1 − sq) / (1 − sq²)과 비교해 보자.
  5. 측정N = 20, ‘무작위로만’으로 10세대를 진행하고, ‘새 모둠으로 다시’를 눌러 세 모둠 이상 결과를 겹쳐 보자. 그다음 N을 5와 50으로 바꿔 흔들림을 비교하고, ‘aa 모두 제거’와 ‘이주’로도 해 보자. 매 세대 관찰한 유전자형이 p² : 2pq : q²과 맞는지 χ²로 확인한다.
  6. 오차·안전이 모형은 세대가 겹치지 않고, 성별이 없고, 모든 개체가 같은 수의 자손을 남긴다고 가정한다. 실제 실험에서는 콩을 다시 넣지 않고 뽑는지, 다음 세대 주머니를 만들 때 계산을 반올림했는지에 따라서도 결과가 달라진다. 바닥에 떨어진 콩은 미끄러울 수 있으니 바로 줍고, 실험에 쓴 콩은 먹지 않는다.

확인조건이 달라지면

처음 p = 0.5에서 ‘aa 모두 제거’ 규칙으로 10세대를 진행했다. 흰 콩(a)은 어떻게 될까?

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