나뭇잎 교과서

분류군의 특징과 계통수

계통수는 생물들이 공통 조상에서 갈라져 나온 순서를 그린 지도입니다. 지도를 잘못 읽으면 “사람은 침팬지에서 진화했다” 같은 오해가 생깁니다. 먼저 계통수를 바르게 읽는 법을 익히고, 이어서 형질 표만으로 척추동물의 계통수를 직접 그려 봅니다.

본문

분류군의 특징과 계통수

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사람과 침팬지는 DNA 염기 서열이 약 1.2%만 다르고, 사람과 오랑우탄은 약 3%가 다르다. 서열의 차이가 클수록 갈라진 지 오래되었다면, 여러 생물의 DNA를 비교하여 누가 누구와 더 가까운 친척인지 족보처럼 그려 볼 수 있지 않을까? 그 그림은 어떻게 읽어야 할까?

그림 1. 계통수에서 두 종을 거슬러 올라가 만나는 갈림점이 가장 가까운 공통 조상이다. 갈림점이 뿌리 쪽에 있을수록 오래전에 갈라졌고 서열 차이도 크다(서열 차이는 대략값).
먼저 알아야 할 것분류 단계(생물의 분류 체계), 공통 조상과 진화(진화의 원리).

3.5.1계통수 읽기

생물이 공통 조상에서 갈라져 온 과정을 나뭇가지 모양으로 나타낸 것을 계통수라 한다. 가지 끝은 오늘날의 종이고, 가지가 갈라지는 점은 두 계통의 공통 조상이다. 뿌리에서 가까운 갈림점일수록 오래전에 갈라진 것이다. 모든 생물은 거슬러 올라가면 하나의 공통 조상에서 갈라져 나왔다고 본다.

정리 3.5.1 계통수에서 유연관계 판단

두 종의 가장 가까운 공통 조상(두 가지가 만나는 가장 최근의 갈림점)이 최근일수록 가까운 관계이다. 가지 끝에 놓인 순서나 거리는 관계를 뜻하지 않으며, 갈림점을 축으로 가지를 돌려도 같은 계통수이다.

그림 1에서 두 종을 바꾸어 고르면 두 종이 만나는 갈림점이 표시된다. 사람과 침팬지는 가장 최근의 갈림점에서 만나고, 사람과 긴팔원숭이는 뿌리 가까이에서야 만난다. 계통수에서 옆에 붙어 그려졌다는 것만으로 가깝다고 판단하면 안 된다. 또 오늘날의 침팬지가 사람의 조상인 것은 아니다. 사람과 침팬지는 약 600만 년 전의 공통 조상에서 갈라져 각자 진화해 온 사촌 관계이다.

3.5.2형질과 서열로 계통수 그리기

계통수는 생물들이 가진 형질을 비교하여 그린다. 척추, 턱, 네 다리, 양막이 있는 알처럼 진화 과정에서 새로 생겨난 형질을 공유하는 생물끼리 묶으면 갈림점의 순서를 알 수 있다. 최근에는 DNA나 단백질의 서열을 비교하여, 차이가 적은 것끼리 먼저 묶는 방법을 많이 쓴다. 돌연변이는 시간에 따라 대체로 꾸준히 쌓이므로, 서열 차이는 갈라진 뒤 흐른 시간을 어림하는 시계 구실을 한다.1

칠성장어고등어개구리도마뱀사람 턱네 다리양막 알털, 젖
그림 2. 줄기의 각 지점에서 새로운 형질이 생겨나고, 그 위의 모든 가지가 그 형질을 공유한다.

3.5.3예제 풀이

예제 3.5.2

네 종 A, B, C, D의 어떤 유전자 서열을 비교했더니 서로 다른 염기의 수가 A-B 2, A-C 8, A-D 12, B-C 8, B-D 12, C-D 12였다. 이 자료로 계통수를 그리는 순서를 설명하여라.

차이가 가장 작은 A와 B를 먼저 하나로 묶는다. 다음으로 (A, B) 무리와 C의 차이는 8, (A, B)와 D는 12이므로 C를 다음에 묶는다.

D는 나머지 모두와 12로 차이가 가장 크므로 가장 먼저 갈라진 계통이다. 따라서 계통수는 D가 맨 먼저 갈라지고, 그다음 C가, 마지막으로 A와 B가 갈라진 모양이 되며, 괄호로 쓰면 (((A, B), C), D)이다. 차이가 일정한 속도로 쌓인다면 A와 B는 C보다 약 4배 늦게 갈라졌다고 어림할 수 있다.

분류 단계와 계통수는 같은 정보를 서로 다른 방식으로 보여 준다. 같은 과에 속한 생물들은 계통수에서 비교적 최근의 갈림점으로 묶이고, 같은 문에 속한 생물들은 더 뿌리 쪽의 갈림점으로 묶인다. 아래 탐구 카드에서 분류 열쇠로 생물의 문을 찾고, 계통수를 읽고 그려 보며, 서열 차이로 계통수를 만들어 보자.

  1. 이를 분자 시계라 한다. 화석으로 갈라진 시기를 아는 두 종의 서열 차이로 시계의 속도를 맞춘 뒤, 다른 종들이 갈라진 시기를 어림한다. 유전자마다 돌연변이가 쌓이는 속도가 달라 보정이 필요하다.
마무리

계통수는 공통 조상에서 갈라진 과정을 나타내며, 두 종이 만나는 갈림점이 최근일수록 가까운 관계이다. 계통수는 새로 생긴 형질의 공유나 DNA 서열의 차이로 그리며, 차이가 적은 것끼리 먼저 묶는다. 그래서 처음 질문처럼 여러 생물의 DNA 차이를 비교하면 누가 더 가까운 친척인지 족보처럼 그릴 수 있다.

탐구 1

질문 몇 개로 처음 보는 생물의 문(門)을 알아낼 수 있을까?

분류 검색표 · 식물과 동물의 문 · 계통 분류
검색표
생물
방식
형질 카드

    답한 질문
    —
    틀린 답
    —
    도착한 무리
    —

    위쪽 가지가 ‘아니요’, 아래쪽 가지가 ‘예’이다. 원구의 운명, 배엽 수, 탈피처럼 겉으로 보이지 않는 형질은 발생과 생활사를 조사한 결과로 형질 카드에 적어 두었다. 분류군 이름은 고등학교 수준의 문(식물은 무리) 단위이다.

    1. 질문산길에서 처음 보는 풀을 만나거나 갯바위에서 낯선 동물을 보았다. 이름을 몰라도 몇 가지 질문에 ‘예’, ‘아니요’로 답하기만 하면 그 생물이 어느 문에 속하는지 알아낼 수 있을까?
    2. 복원생물은 종, 속, 과, 목, 강, 문, 계, 역 순서로 묶이고, 같은 문의 생물은 몸의 기본 설계를 공유한다. 그래서 식물은 관다발, 씨, 씨방으로, 동물은 조직, 배엽, 원구의 운명, 탈피, 체절 같은 형질로 무리를 나눈다.
    3. 설명분류 검색표는 두 갈래 질문을 차례로 이어 놓은 표이다. 질문 하나에 답할 때마다 후보가 둘로 갈리고, 마지막에 무리 하나만 남는다. 좋은 질문은 누가 보아도 답이 같고, 답이 ‘예’와 ‘아니요’로 뚜렷하게 갈린다. 그래서 “크다”, “흔하다” 같은 질문은 쓸 수 없다.
    4. 연결식물 검색표의 질문 순서(관다발, 씨, 씨방)는 이 형질들이 진화 과정에서 생긴 순서와 같다. 그래서 검색표의 모양이 식물 계통수와 닮았고, 동물 검색표도 조직, 3배엽, 선구와 후구, 탈피로 이어져 동물 계통수의 큰 가지를 따라간다.
    5. 적용식물에서 은행나무를 골라 힌트를 보며 따라가 보자. 그다음 동물로 바꾸고 ‘직접 분류’에서 거미와 불가사리를 형질 카드만 보고 분류해 보자. 거미에서 ‘체절이 있으니 환형동물’이라고 생각해 일부러 다섯째 질문에 ‘아니요’라고 답하면 어디에 도착하는지도 확인해 보자.
    6. 판단검색표는 이름을 찾는 도구이고, 질문 하나는 형질 하나만 본다. 사는 곳이나 몸의 대칭 같은 겉모습 하나로 나누면 인위 분류가 되어 관계를 틀리게 묶는다. 가령 불가사리는 어른 몸이 방사 대칭이지만 해파리보다 사람에 더 가까운 후구동물이다. 기생 생활로 형질이 사라진 생물처럼 예외도 있어서, 계통 분류는 여러 형질과 DNA를 함께 비교해 공통 조상에서 갈라진 순서를 따른다.

    확인질문의 순서

    처음 보는 동물이 진정한 조직과 3배엽을 가진 선구동물이다. 몸이 체절로 나뉘어 있고, 자라면서 탈피하며, 마디가 있는 다리가 있다. 위의 동물 검색표로 찾으면 어느 무리일까?

    탐구 2

    계통수는 어떻게 읽을까?

    공통 조상 · 가지 돌리기
    고른 두 생물
    —
    가장 가까운 공통 조상
    —
    그 아래 함께 드는 생물
    —

    분기 순서만 나타낸 계통수이다. 가지의 길이와 가로 위치는 시간이나 변화의 양을 뜻하지 않는다.

    1. 질문이 계통수에서 사람 바로 아래에 침팬지와 고릴라, 그다음에 생쥐가 그려져 있다. 이름이 가까이 붙어 있을수록 가까운 친척일까?
    2. 복원계통수의 분기점 하나는 공통 조상 하나이다. 그리고 분기점에서 두 가지로 갈라진 뒤 각 가지는 따로 진화했다.
    3. 설명그래서 두 생물이 얼마나 가까운지는 둘을 잇는 가장 가까운 공통 조상이 얼마나 최근인가로 정한다. 뿌리에서 먼 분기점을 공유할수록, 곧 더 늦게 갈라졌을수록 가까운 사이이다.
    4. 연결분기점은 모빌의 매듭과 같아서, 매듭을 중심으로 가지를 돌려도 매달린 관계는 그대로이다. 따라서 끝에 적힌 이름의 순서는 계통수를 읽는 기준이 아니다.
    5. 적용‘개구리 · 고등어’와 ‘개구리 · 사람’을 차례로 눌러 개구리가 누구와 더 늦게까지 조상을 함께했는지 보자. 그다음 ‘가지 뒤섞기’를 여러 번 눌러도 답이 바뀌지 않는지 확인해 보자.
    6. 판단계통수에는 흔한 오해가 셋 있다. 첫째는 끝이나 위쪽에 그려진 생물이 더 진화했다는 생각인데, 끝 가지의 생물은 모두 공통 조상에서 같은 시간 동안 진화해 온 현생 생물이다. 둘째는 “사람은 침팬지에서 진화했다”는 생각인데, 둘은 공통 조상을 나눠 가진 사촌 관계이다. 셋째로, 이 그림처럼 가지 길이가 시간을 뜻하지 않는 계통수도 많다.

    확인조건이 달라지면

    닭은 사람처럼 체온이 일정하고, 도마뱀은 체온이 바깥 온도를 따라 바뀐다. 계통수로 볼 때 닭과 더 가까운 쪽은?

    탐구 3

    형질 표로 계통수를 그릴 수 있을까?

    공유 파생 형질 · 척추동물 분류군

    넣을 형질 (표의 줄을 눌러도 됩니다)

    넣은 형질
    —
    분기점
    —
    표와 나무
    —

    창고기는 척추가 없는 척삭동물로, 비교 기준이 되는 외군이다. 개구리의 ‘평생 물속’ 칸은 비어 있는데, 어릴 때만 물속에서 아가미로 숨 쉬기 때문이다.

    1. 질문계통수는 무엇을 근거로 그릴까? 화석이나 DNA 없이 형질 표만 보고도 척추동물의 계통수를 그릴 수 있을까?
    2. 복원가까운 친척일수록 더 최근의 공통 조상을 공유한다. 그래서 그 조상에게서 물려받은 형질도 더 많이 함께 가진다.
    3. 설명어떤 무리에서 처음 생겨 그 후손들만 함께 가진 형질을 공유 파생 형질이라고 한다. 가령 턱은 턱이 있는 척추동물의 공통 조상에서 처음 생겼으니, 턱을 가진 생물들은 한 가지로 묶인다.
    4. 연결척추를 가진 무리 안에 턱을 가진 무리가 있고, 그 안에 단단한 뼈, 네 다리, 양막, 털과 젖을 가진 무리가 차례로 들어 있다. 이렇게 형질을 가진 무리가 양파 껍질처럼 안쪽으로 포개지고, 포개진 순서가 곧 갈라진 순서이다. 그래서 어류, 양서류, 파충류, 포유류 같은 분류군의 특징이 이 가지들에 붙어 있다.
    5. 적용위의 여섯 형질을 아무 순서로 넣어 나무를 완성하고, 순서를 바꿔도 같은 나무가 나오는지 보자. 그다음 ‘평생 물속에서 산다’와 ‘비늘’을 넣어 보고, 왜 빠지는지도 생각해 보자.
    6. 판단모든 형질이 계통을 알려 주지는 않는다. 외군도 가진 오래된 형질은 무리를 나누지 못하고, 따로 생긴 비슷한 형질은 없는 관계를 만들어 낸다. 그래서 실제 연구에서는 수많은 형질과 DNA 염기 서열을 함께 비교해, 서로 어긋나는 형질이 가장 적은 나무를 고른다.

    확인조건이 달라지면

    새로 발견한 척추동물 X는 턱, 단단한 뼈, 네 다리가 있지만 양막으로 싸인 알을 낳지 않는다. X를 이 계통수의 어디에 붙여야 할까?

    탐구 4

    DNA 서열의 차이로 계통수를 그릴 수 있을까?

    분자 계통 · 거리 행렬 · UPGMA · 분자 시계
    자료
    쓸 길이

    줄을 누르면 그 생물이 비교 기준이 됩니다. 노란 칸이 기준과 다른 자리입니다.

    단계
    —
    방금 묶은 둘
    —
    만난 위치(평균 차이)
    —

    교육용으로 줄인 가상 서열이다. DNA는 실제 유전체 비교에서 얻은 차이 비율(사람과 침팬지 약 1.2%, 고릴라 약 1.6%, 오랑우탄 약 3%, 붉은털원숭이 약 6~7%)의 순서와 대략적인 비를 본떴고, 단백질은 시토크롬 c를 본떠 차이를 줄였다(실제 104개 남짓한 아미노산에서 사람과의 차이는 붉은털원숭이 1개, 개 11개, 닭 13개, 효모 40여 개이다).

    1. 질문사람, 침팬지, 고릴라 가운데 누가 누구와 가장 가까울까? 겉모습은 보는 사람에 따라 판단이 갈린다. 생김새 대신 DNA 서열의 차이만 세어서 계통수를 그릴 수 있을까?
    2. 복원생물은 공통 조상에게서 DNA를 물려받는다. 두 계통이 갈라진 뒤에는 각 계통에서 돌연변이가 따로 쌓이므로, 갈라진 지 오래된 두 종일수록 같은 유전자의 서열 차이가 크다.
    3. 설명같은 유전자를 자리가 맞게 나란히 놓고(정렬), 두 종마다 다른 자리의 수를 세면 거리 행렬이 된다. UPGMA는 행렬에서 가장 작은 칸의 두 무리를 하나로 묶고, 새 무리와 나머지 사이의 거리를 원래 거리들의 평균으로 바꾼 뒤 이 과정을 되풀이한다. 그래서 묶인 순서가 곧 갈라진 순서의 역순이다.
    4. 연결돌연변이가 거의 일정한 속도로 쌓인다면 서열 차이는 갈라진 뒤 흐른 시간에 비례하는데, 이것이 분자 시계이다. 화석으로 한 분기 시점(예를 들어 사람과 침팬지, 약 600만~700만 년 전)을 정하면 다른 분기 시점도 어림할 수 있다. 단백질의 아미노산 서열로도 같은 방법을 쓴다.
    5. 적용‘가장 가까운 둘 묶기’를 누를 때마다 표의 초록 칸이 나무의 어느 가지가 되는지, 표가 어떻게 한 줄씩 줄어드는지 보자. 그다음 쓸 길이를 ‘앞 12자리’로 줄여 사람, 침팬지, 고릴라, 오랑우탄을 구별할 수 있는지 확인하고, 단백질로 바꾸면 효모가 어디에 붙는지도 보자.
    6. 판단이 방법은 모든 계통에서 변이 속도가 같다고 가정하므로, 한 계통만 빨리 변하면 나무가 틀어진다. 또 같은 자리에 변이가 두 번 일어나 원래대로 돌아가면 차이로 세지 못해, 먼 관계일수록 거리를 작게 잡는다. 서열이 짧으면 차이가 0인 동점이 생겨 순서를 정할 수 없다. 그래서 실제 연구는 수천~수백만 자리와 여러 유전자를 비교하고, 더 정교한 방법도 함께 쓴다. 유전자마다 나무가 조금씩 다를 수도 있어서, 사람 유전체의 일부 구간은 침팬지보다 고릴라와 더 비슷하다.

    확인묶은 뒤의 거리

    세 종 A, B, C의 서열 차이가 A–B 4, A–C 10, B–C 12이다. UPGMA로 A와 B를 먼저 묶었다면, 새 무리 (A, B)와 C 사이의 거리는 얼마로 계산할까?

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